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短信通知营业执照异常的可信度因具体情况而异。
确实存在政府部门或相关机构通过短信通知企业营业执照异常的情况，这可能是因为他们检测到了企业的某些指标异常，需要进行核实或处理，在这种情况下，短信通知是可信的。
也存在诈骗分子通过伪造短信通知来骗取钱财的情况，他们可能会模仿政府部门的口吻，声称营业执照存在问题，需要点击链接或回复信息来处理，以此来骗取钱财或获取个人信息，收到此类短信时，需要保持警惕，谨慎对待。
为了确保短信的真实性，可以采取以下措施：
1、核实短信发送号码：可以通过拨打当地工商部门的电话，核实短信是否由官方发送。
2、验证短信内容：不要轻信短信中的链接，尤其是让提供个人信息或支付信息的链接。
3、直接与相关部门联系：如果收到关于营业执照异常的短信，可以直接联系当地工商部门或相关部门进行核实。
收到营业执照异常的短信通知时，需要谨慎对待，核实短信的真实性和来源，避免上当受骗。